Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCAP28676 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCAP28676 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCAP28676 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCAP28676 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCAP28676 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCAP28676 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCAP28676 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCAP28676 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCAP28676 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCAP28676 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCAP28676 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCAP28676 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCAP28676 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCAP28676 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCAP28676 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCAP28676 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCAP28676 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCAP28676 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GCAP28676 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCAP28676 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCAP28676 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCAP28676 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCAP28676 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCAP28676 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCAP28676 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCAP28676 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCAP28676 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GCAP28676 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GCAP28676 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCAP28676 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCAP28676 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCAP28676 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCAP28676 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCAP28676 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCAP28676 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCAP28676 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCAP28676 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCAP28676 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCAP28676 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCAP28676 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCAP28676 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCAP28676 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCAP28676 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCAP28676 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCAP28676 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCAP28676 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCAP28676 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCAP28676 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCAP28676 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCAP28676 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCAP28676 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCAP28676 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCAP28676 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCAP28676 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GCAP28676 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCAP28676 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCAP28676 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCAP28676 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCAP28676 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCAP28676 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCAP28676 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GCAP28676 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCAP28676 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCAP28676 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCAP28676 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCAP28676 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCAP28676 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCAP28676 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCAP28676 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCAP28676 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCAP28676 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCAP28676 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCAP28676 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCAP28676 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCAP28676 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCAP28676 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCAP28676 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCAP28676 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GCAP28676 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCAP28676 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GCAP28676 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCAP28676 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCAP28676 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms