Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sept4P28661 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sept4P28661 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sept4P28661 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sept4P28661 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept4P28661 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept4P28661 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept4P28661 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sept4P28661 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept4P28661 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept4P28661 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept4P28661 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sept4P28661 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms