Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxd10P28359 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd10P28359 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd10P28359 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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