Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNCP24863 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNCP24863 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNCP24863 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNCP24863 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNCP24863 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNCP24863 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNCP24863 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNCP24863 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNCP24863 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNCP24863 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNCP24863 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNCP24863 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNCP24863 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNCP24863 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNCP24863 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNCP24863 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNCP24863 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNCP24863 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNCP24863 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNCP24863 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNCP24863 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNCP24863 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNCP24863 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNCP24863 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNCP24863 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNCP24863 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNCP24863 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNCP24863 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNCP24863 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNCP24863 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNCP24863 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNCP24863 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNCP24863 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNCP24863 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNCP24863 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNCP24863 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNCP24863 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNCP24863 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNCP24863 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNCP24863 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNCP24863 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNCP24863 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNCP24863 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNCP24863 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNCP24863 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNCP24863 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNCP24863 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNCP24863 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNCP24863 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNCP24863 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNCP24863 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNCP24863 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNCP24863 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNCP24863 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNCP24863 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNCP24863 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNCP24863 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNCP24863 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNCP24863 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNCP24863 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNCP24863 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNCP24863 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNCP24863 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNCP24863 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNCP24863 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNCP24863 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNCP24863 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNCP24863 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNCP24863 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNCP24863 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNCP24863 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNCP24863 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNCP24863 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNCP24863 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNCP24863 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNCP24863 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNCP24863 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNCP24863 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNCP24863 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNCP24863 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNCP24863 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNCP24863 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNCP24863 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNCP24863 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms