Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cdk11bP24788 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdk11bP24788 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Cdk11bP24788 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk11bP24788 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms