Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NR2F2P24468 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR2F2P24468 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2F2P24468 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms