Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf239P24399 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf239P24399 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf239P24399 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf239P24399 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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