Protein–RNA interactions for Protein: P22894

MMP8, Neutrophil collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP8P22894 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP8P22894 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP8P22894 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP8P22894 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP8P22894 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP8P22894 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP8P22894 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP8P22894 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP8P22894 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP8P22894 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP8P22894 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP8P22894 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP8P22894 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP8P22894 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP8P22894 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP8P22894 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP8P22894 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP8P22894 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP8P22894 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP8P22894 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP8P22894 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP8P22894 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP8P22894 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP8P22894 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP8P22894 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP8P22894 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP8P22894 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP8P22894 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP8P22894 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP8P22894 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP8P22894 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP8P22894 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP8P22894 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP8P22894 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP8P22894 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP8P22894 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP8P22894 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP8P22894 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP8P22894 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP8P22894 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP8P22894 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP8P22894 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP8P22894 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP8P22894 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP8P22894 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP8P22894 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP8P22894 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP8P22894 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP8P22894 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP8P22894 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP8P22894 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP8P22894 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP8P22894 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP8P22894 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP8P22894 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP8P22894 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP8P22894 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP8P22894 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP8P22894 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MMP8P22894 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MMP8P22894 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP8P22894 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP8P22894 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP8P22894 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP8P22894 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP8P22894 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP8P22894 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP8P22894 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP8P22894 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP8P22894 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP8P22894 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP8P22894 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP8P22894 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP8P22894 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP8P22894 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP8P22894 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP8P22894 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP8P22894 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP8P22894 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP8P22894 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP8P22894 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP8P22894 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP8P22894 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP8P22894 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms