Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME2P22392 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME2P22392 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME2P22392 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME2P22392 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME2P22392 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME2P22392 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME2P22392 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME2P22392 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NME2P22392 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME2P22392 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME2P22392 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME2P22392 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME2P22392 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME2P22392 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME2P22392 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME2P22392 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME2P22392 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME2P22392 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME2P22392 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME2P22392 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME2P22392 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NME2P22392 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NME2P22392 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME2P22392 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME2P22392 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME2P22392 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME2P22392 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME2P22392 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME2P22392 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME2P22392 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME2P22392 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME2P22392 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME2P22392 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME2P22392 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME2P22392 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME2P22392 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME2P22392 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME2P22392 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P22392 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P22392 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P22392 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P22392 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P22392 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P22392 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME2P22392 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P22392 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P22392 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P22392 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P22392 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P22392 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P22392 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P22392 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P22392 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P22392 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P22392 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P22392 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME2P22392 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME2P22392 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME2P22392 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME2P22392 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME2P22392 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME2P22392 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME2P22392 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME2P22392 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME2P22392 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P22392 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P22392 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P22392 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P22392 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P22392 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P22392 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P22392 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME2P22392 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME2P22392 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P22392 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P22392 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P22392 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P22392 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P22392 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P22392 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P22392 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P22392 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME2P22392 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms