Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYT1P21579 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYT1P21579 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYT1P21579 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYT1P21579 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYT1P21579 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYT1P21579 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYT1P21579 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYT1P21579 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYT1P21579 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYT1P21579 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYT1P21579 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYT1P21579 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYT1P21579 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYT1P21579 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYT1P21579 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYT1P21579 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYT1P21579 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYT1P21579 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYT1P21579 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYT1P21579 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYT1P21579 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYT1P21579 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYT1P21579 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYT1P21579 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYT1P21579 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYT1P21579 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYT1P21579 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SYT1P21579 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYT1P21579 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYT1P21579 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYT1P21579 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYT1P21579 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYT1P21579 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT1P21579 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT1P21579 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT1P21579 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYT1P21579 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT1P21579 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT1P21579 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT1P21579 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYT1P21579 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT1P21579 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT1P21579 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT1P21579 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT1P21579 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT1P21579 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT1P21579 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT1P21579 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT1P21579 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT1P21579 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT1P21579 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT1P21579 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT1P21579 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT1P21579 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT1P21579 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT1P21579 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT1P21579 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT1P21579 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT1P21579 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT1P21579 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT1P21579 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT1P21579 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT1P21579 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT1P21579 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT1P21579 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT1P21579 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT1P21579 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT1P21579 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT1P21579 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT1P21579 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT1P21579 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT1P21579 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT1P21579 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT1P21579 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT1P21579 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT1P21579 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT1P21579 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT1P21579 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT1P21579 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT1P21579 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT1P21579 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT1P21579 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT1P21579 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT1P21579 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT1P21579 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT1P21579 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT1P21579 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT1P21579 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT1P21579 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT1P21579 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT1P21579 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT1P21579 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT1P21579 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT1P21579 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYT1P21579 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYT1P21579 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYT1P21579 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYT1P21579 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYT1P21579 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 700.8 ms