Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lsp1P19973 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsp1P19973 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms