Protein–RNA interactions for Protein: P19788

Mgp, Matrix Gla protein, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MgpP19788 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MgpP19788 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MgpP19788 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MgpP19788 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MgpP19788 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MgpP19788 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MgpP19788 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MgpP19788 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MgpP19788 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MgpP19788 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MgpP19788 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MgpP19788 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MgpP19788 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MgpP19788 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MgpP19788 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MgpP19788 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MgpP19788 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MgpP19788 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MgpP19788 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MgpP19788 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MgpP19788 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MgpP19788 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MgpP19788 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MgpP19788 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MgpP19788 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MgpP19788 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MgpP19788 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MgpP19788 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MgpP19788 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MgpP19788 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MgpP19788 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MgpP19788 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MgpP19788 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MgpP19788 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MgpP19788 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MgpP19788 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MgpP19788 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MgpP19788 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MgpP19788 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MgpP19788 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MgpP19788 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MgpP19788 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MgpP19788 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MgpP19788 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MgpP19788 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MgpP19788 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MgpP19788 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MgpP19788 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MgpP19788 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MgpP19788 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MgpP19788 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MgpP19788 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MgpP19788 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MgpP19788 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MgpP19788 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MgpP19788 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MgpP19788 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MgpP19788 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MgpP19788 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MgpP19788 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MgpP19788 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MgpP19788 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MgpP19788 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MgpP19788 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MgpP19788 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MgpP19788 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MgpP19788 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MgpP19788 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MgpP19788 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MgpP19788 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MgpP19788 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MgpP19788 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MgpP19788 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MgpP19788 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MgpP19788 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MgpP19788 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MgpP19788 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MgpP19788 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MgpP19788 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MgpP19788 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MgpP19788 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MgpP19788 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MgpP19788 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MgpP19788 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MgpP19788 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MgpP19788 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MgpP19788 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MgpP19788 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MgpP19788 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MgpP19788 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MgpP19788 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MgpP19788 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MgpP19788 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MgpP19788 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MgpP19788 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MgpP19788 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MgpP19788 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MgpP19788 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MgpP19788 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MgpP19788 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms