Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A1P19634 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms