Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefhP19246 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefhP19246 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NefhP19246 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefhP19246 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefhP19246 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NefhP19246 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefhP19246 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefhP19246 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NefhP19246 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefhP19246 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefhP19246 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefhP19246 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefhP19246 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefhP19246 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefhP19246 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefhP19246 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefhP19246 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NefhP19246 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefhP19246 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefhP19246 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefhP19246 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NefhP19246 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NefhP19246 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefhP19246 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefhP19246 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefhP19246 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NefhP19246 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefhP19246 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefhP19246 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefhP19246 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefhP19246 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefhP19246 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefhP19246 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefhP19246 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefhP19246 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefhP19246 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefhP19246 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefhP19246 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefhP19246 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefhP19246 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefhP19246 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefhP19246 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefhP19246 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefhP19246 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefhP19246 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefhP19246 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefhP19246 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefhP19246 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefhP19246 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefhP19246 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefhP19246 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefhP19246 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefhP19246 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NefhP19246 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NefhP19246 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefhP19246 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefhP19246 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefhP19246 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefhP19246 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefhP19246 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NefhP19246 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NefhP19246 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NefhP19246 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefhP19246 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefhP19246 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefhP19246 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefhP19246 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NefhP19246 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NefhP19246 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NefhP19246 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NefhP19246 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NefhP19246 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NefhP19246 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NefhP19246 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NefhP19246 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NefhP19246 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefhP19246 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefhP19246 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefhP19246 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefhP19246 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefhP19246 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefhP19246 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefhP19246 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefhP19246 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefhP19246 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefhP19246 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefhP19246 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NefhP19246 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefhP19246 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefhP19246 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefhP19246 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefhP19246 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefhP19246 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefhP19246 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NefhP19246 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefhP19246 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefhP19246 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NefhP19246 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefhP19246 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms