Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phka1P18826 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phka1P18826 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Phka1P18826 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phka1P18826 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phka1P18826 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phka1P18826 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phka1P18826 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phka1P18826 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Phka1P18826 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phka1P18826 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phka1P18826 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phka1P18826 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phka1P18826 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phka1P18826 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phka1P18826 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phka1P18826 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms