Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGAM1P18669 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAM1P18669 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms