Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb1P17919 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms