Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pou4f1P17208 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pou4f1P17208 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms