Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sptan1P16546 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms