Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LdhbP16125 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LdhbP16125 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LdhbP16125 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LdhbP16125 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LdhbP16125 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LdhbP16125 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LdhbP16125 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LdhbP16125 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LdhbP16125 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LdhbP16125 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LdhbP16125 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LdhbP16125 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LdhbP16125 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LdhbP16125 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LdhbP16125 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LdhbP16125 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms