Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MTHFD2P13995 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTHFD2P13995 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms