Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCG2P13521 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCG2P13521 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCG2P13521 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SCG2P13521 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCG2P13521 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCG2P13521 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCG2P13521 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCG2P13521 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCG2P13521 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SCG2P13521 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCG2P13521 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCG2P13521 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCG2P13521 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCG2P13521 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCG2P13521 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCG2P13521 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCG2P13521 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCG2P13521 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCG2P13521 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCG2P13521 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCG2P13521 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCG2P13521 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCG2P13521 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCG2P13521 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCG2P13521 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCG2P13521 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCG2P13521 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCG2P13521 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCG2P13521 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCG2P13521 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCG2P13521 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SCG2P13521 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCG2P13521 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCG2P13521 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SCG2P13521 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCG2P13521 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCG2P13521 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCG2P13521 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCG2P13521 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCG2P13521 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCG2P13521 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCG2P13521 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCG2P13521 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCG2P13521 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCG2P13521 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCG2P13521 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCG2P13521 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCG2P13521 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCG2P13521 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCG2P13521 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCG2P13521 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCG2P13521 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCG2P13521 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCG2P13521 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCG2P13521 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCG2P13521 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SCG2P13521 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCG2P13521 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCG2P13521 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCG2P13521 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCG2P13521 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCG2P13521 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCG2P13521 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCG2P13521 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCG2P13521 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCG2P13521 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCG2P13521 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SCG2P13521 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCG2P13521 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCG2P13521 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCG2P13521 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCG2P13521 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCG2P13521 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCG2P13521 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCG2P13521 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCG2P13521 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCG2P13521 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCG2P13521 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCG2P13521 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SCG2P13521 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCG2P13521 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SCG2P13521 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SCG2P13521 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCG2P13521 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCG2P13521 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCG2P13521 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCG2P13521 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCG2P13521 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCG2P13521 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCG2P13521 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCG2P13521 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCG2P13521 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCG2P13521 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCG2P13521 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCG2P13521 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCG2P13521 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCG2P13521 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCG2P13521 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCG2P13521 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173 ms