Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMP2P13473 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMP2P13473 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMP2P13473 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMP2P13473 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMP2P13473 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMP2P13473 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMP2P13473 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMP2P13473 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMP2P13473 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMP2P13473 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMP2P13473 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms