Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd5P13379 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd5P13379 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd5P13379 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd5P13379 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd5P13379 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd5P13379 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd5P13379 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd5P13379 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd5P13379 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd5P13379 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd5P13379 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd5P13379 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd5P13379 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd5P13379 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd5P13379 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd5P13379 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd5P13379 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd5P13379 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd5P13379 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd5P13379 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd5P13379 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd5P13379 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd5P13379 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd5P13379 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd5P13379 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd5P13379 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd5P13379 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms