Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrm1P12657 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrm1P12657 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms