Protein–RNA interactions for Protein: P11908

PRPS2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS2P11908 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPS2P11908 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPS2P11908 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPS2P11908 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms