Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNB1P11230 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNB1P11230 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms