Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARBP10826 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RARBP10826 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARBP10826 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARBP10826 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARBP10826 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARBP10826 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARBP10826 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARBP10826 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RARBP10826 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARBP10826 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARBP10826 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARBP10826 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARBP10826 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARBP10826 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARBP10826 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARBP10826 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARBP10826 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARBP10826 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARBP10826 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARBP10826 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARBP10826 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARBP10826 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARBP10826 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RARBP10826 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARBP10826 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARBP10826 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARBP10826 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARBP10826 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RARBP10826 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARBP10826 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARBP10826 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARBP10826 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARBP10826 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARBP10826 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARBP10826 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARBP10826 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARBP10826 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARBP10826 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RARBP10826 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARBP10826 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARBP10826 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARBP10826 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RARBP10826 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RARBP10826 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARBP10826 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RARBP10826 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARBP10826 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARBP10826 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARBP10826 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARBP10826 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARBP10826 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARBP10826 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARBP10826 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARBP10826 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARBP10826 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARBP10826 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RARBP10826 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARBP10826 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARBP10826 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARBP10826 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARBP10826 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARBP10826 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RARBP10826 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARBP10826 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARBP10826 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARBP10826 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARBP10826 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARBP10826 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARBP10826 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARBP10826 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARBP10826 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RARBP10826 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
RARBP10826 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARBP10826 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARBP10826 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARBP10826 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARBP10826 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARBP10826 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARBP10826 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARBP10826 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARBP10826 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARBP10826 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARBP10826 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARBP10826 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARBP10826 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARBP10826 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARBP10826 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RARBP10826 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARBP10826 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARBP10826 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARBP10826 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARBP10826 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARBP10826 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARBP10826 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARBP10826 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARBP10826 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARBP10826 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARBP10826 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARBP10826 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms