Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxb3P09026 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb3P09026 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms