Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYPP08247 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYPP08247 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPP08247 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPP08247 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPP08247 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPP08247 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPP08247 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPP08247 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPP08247 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPP08247 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPP08247 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYPP08247 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYPP08247 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYPP08247 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYPP08247 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYPP08247 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYPP08247 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYPP08247 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYPP08247 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYPP08247 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYPP08247 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYPP08247 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYPP08247 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYPP08247 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYPP08247 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYPP08247 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYPP08247 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYPP08247 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYPP08247 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYPP08247 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYPP08247 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYPP08247 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYPP08247 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYPP08247 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYPP08247 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYPP08247 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYPP08247 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYPP08247 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYPP08247 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYPP08247 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYPP08247 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYPP08247 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYPP08247 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYPP08247 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYPP08247 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYPP08247 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYPP08247 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYPP08247 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYPP08247 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPP08247 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPP08247 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPP08247 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPP08247 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPP08247 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPP08247 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPP08247 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPP08247 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPP08247 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPP08247 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPP08247 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPP08247 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPP08247 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYPP08247 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYPP08247 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYPP08247 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYPP08247 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYPP08247 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYPP08247 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYPP08247 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYPP08247 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYPP08247 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYPP08247 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYPP08247 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYPP08247 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYPP08247 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYPP08247 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYPP08247 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYPP08247 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYPP08247 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYPP08247 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYPP08247 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYPP08247 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYPP08247 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYPP08247 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYPP08247 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYPP08247 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYPP08247 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYPP08247 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYPP08247 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYPP08247 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYPP08247 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYPP08247 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPP08247 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPP08247 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPP08247 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPP08247 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPP08247 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPP08247 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPP08247 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms