Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APODP05090 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APODP05090 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APODP05090 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
APODP05090 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APODP05090 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APODP05090 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APODP05090 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
APODP05090 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APODP05090 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APODP05090 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APODP05090 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APODP05090 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APODP05090 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APODP05090 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APODP05090 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APODP05090 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APODP05090 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APODP05090 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APODP05090 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APODP05090 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APODP05090 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APODP05090 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APODP05090 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APODP05090 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APODP05090 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APODP05090 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APODP05090 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APODP05090 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APODP05090 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APODP05090 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APODP05090 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APODP05090 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APODP05090 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APODP05090 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APODP05090 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APODP05090 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APODP05090 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APODP05090 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APODP05090 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APODP05090 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APODP05090 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APODP05090 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APODP05090 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APODP05090 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APODP05090 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APODP05090 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APODP05090 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APODP05090 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APODP05090 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APODP05090 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APODP05090 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APODP05090 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APODP05090 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APODP05090 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APODP05090 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APODP05090 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APODP05090 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APODP05090 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APODP05090 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APODP05090 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APODP05090 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APODP05090 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APODP05090 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APODP05090 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APODP05090 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APODP05090 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APODP05090 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APODP05090 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APODP05090 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APODP05090 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APODP05090 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
APODP05090 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APODP05090 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APODP05090 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APODP05090 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APODP05090 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APODP05090 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APODP05090 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APODP05090 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APODP05090 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
APODP05090 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APODP05090 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APODP05090 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APODP05090 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APODP05090 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APODP05090 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APODP05090 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APODP05090 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APODP05090 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APODP05090 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APODP05090 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APODP05090 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APODP05090 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APODP05090 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APODP05090 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APODP05090 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APODP05090 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APODP05090 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APODP05090 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1075.5 ms