Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrygdP04342 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrygdP04342 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrygdP04342 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrygdP04342 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrygdP04342 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrygdP04342 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrygdP04342 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CrygdP04342 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CrygdP04342 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CrygdP04342 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CrygdP04342 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrygdP04342 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CrygdP04342 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrygdP04342 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrygdP04342 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrygdP04342 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CrygdP04342 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrygdP04342 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrygdP04342 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms