Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B2mP01887 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
B2mP01887 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
B2mP01887 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
B2mP01887 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B2mP01887 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B2mP01887 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
B2mP01887 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B2mP01887 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B2mP01887 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B2mP01887 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B2mP01887 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
B2mP01887 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
B2mP01887 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B2mP01887 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B2mP01887 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B2mP01887 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B2mP01887 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B2mP01887 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B2mP01887 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B2mP01887 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B2mP01887 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B2mP01887 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B2mP01887 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B2mP01887 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B2mP01887 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B2mP01887 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B2mP01887 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B2mP01887 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B2mP01887 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B2mP01887 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B2mP01887 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B2mP01887 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B2mP01887 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B2mP01887 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B2mP01887 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B2mP01887 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B2mP01887 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B2mP01887 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B2mP01887 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
B2mP01887 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B2mP01887 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B2mP01887 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B2mP01887 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B2mP01887 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B2mP01887 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B2mP01887 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B2mP01887 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B2mP01887 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B2mP01887 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B2mP01887 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B2mP01887 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B2mP01887 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B2mP01887 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B2mP01887 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B2mP01887 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B2mP01887 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B2mP01887 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B2mP01887 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
B2mP01887 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
B2mP01887 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B2mP01887 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B2mP01887 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B2mP01887 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B2mP01887 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B2mP01887 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B2mP01887 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B2mP01887 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B2mP01887 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B2mP01887 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B2mP01887 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B2mP01887 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B2mP01887 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B2mP01887 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B2mP01887 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B2mP01887 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B2mP01887 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B2mP01887 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B2mP01887 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B2mP01887 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B2mP01887 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
B2mP01887 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B2mP01887 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B2mP01887 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
B2mP01887 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
B2mP01887 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
B2mP01887 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
B2mP01887 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
B2mP01887 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
B2mP01887 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
B2mP01887 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
B2mP01887 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
B2mP01887 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
B2mP01887 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
B2mP01887 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
B2mP01887 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
B2mP01887 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
B2mP01887 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
B2mP01887 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
B2mP01887 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms