Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFNB1P01574 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNB1P01574 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNB1P01574 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms