Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED1O96006 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZBED1O96006 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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