Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCA5LO95447 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCA5LO95447 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LCA5LO95447 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCA5LO95447 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms