Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DcxO88809 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DcxO88809 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DcxO88809 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DcxO88809 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DcxO88809 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DcxO88809 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DcxO88809 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DcxO88809 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DcxO88809 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DcxO88809 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DcxO88809 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DcxO88809 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DcxO88809 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DcxO88809 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DcxO88809 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DcxO88809 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DcxO88809 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DcxO88809 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DcxO88809 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DcxO88809 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DcxO88809 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DcxO88809 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DcxO88809 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DcxO88809 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DcxO88809 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DcxO88809 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DcxO88809 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DcxO88809 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DcxO88809 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DcxO88809 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DcxO88809 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DcxO88809 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DcxO88809 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DcxO88809 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DcxO88809 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DcxO88809 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DcxO88809 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DcxO88809 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DcxO88809 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DcxO88809 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DcxO88809 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DcxO88809 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DcxO88809 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DcxO88809 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DcxO88809 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DcxO88809 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DcxO88809 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DcxO88809 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DcxO88809 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DcxO88809 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DcxO88809 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DcxO88809 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DcxO88809 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DcxO88809 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DcxO88809 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DcxO88809 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DcxO88809 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DcxO88809 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DcxO88809 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DcxO88809 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DcxO88809 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DcxO88809 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DcxO88809 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DcxO88809 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DcxO88809 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DcxO88809 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DcxO88809 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DcxO88809 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DcxO88809 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DcxO88809 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DcxO88809 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DcxO88809 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DcxO88809 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DcxO88809 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DcxO88809 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DcxO88809 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DcxO88809 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DcxO88809 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DcxO88809 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DcxO88809 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DcxO88809 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DcxO88809 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DcxO88809 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DcxO88809 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DcxO88809 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DcxO88809 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DcxO88809 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DcxO88809 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DcxO88809 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DcxO88809 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DcxO88809 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DcxO88809 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DcxO88809 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DcxO88809 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DcxO88809 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DcxO88809 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DcxO88809 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DcxO88809 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DcxO88809 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms