Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cfdp1O88271 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cfdp1O88271 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cfdp1O88271 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cfdp1O88271 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms