Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP3O75386 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP3O75386 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP3O75386 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP3O75386 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP3O75386 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP3O75386 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP3O75386 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP3O75386 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP3O75386 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP3O75386 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP3O75386 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP3O75386 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP3O75386 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP3O75386 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP3O75386 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP3O75386 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP3O75386 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP3O75386 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP3O75386 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP3O75386 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP3O75386 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP3O75386 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP3O75386 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TULP3O75386 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP3O75386 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP3O75386 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP3O75386 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TULP3O75386 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP3O75386 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP3O75386 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP3O75386 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP3O75386 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP3O75386 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP3O75386 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP3O75386 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TULP3O75386 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP3O75386 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP3O75386 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP3O75386 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TULP3O75386 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP3O75386 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP3O75386 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP3O75386 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP3O75386 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP3O75386 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP3O75386 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP3O75386 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TULP3O75386 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP3O75386 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP3O75386 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP3O75386 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP3O75386 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP3O75386 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TULP3O75386 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP3O75386 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP3O75386 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP3O75386 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TULP3O75386 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP3O75386 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP3O75386 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP3O75386 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP3O75386 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP3O75386 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP3O75386 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP3O75386 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP3O75386 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TULP3O75386 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP3O75386 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP3O75386 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP3O75386 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP3O75386 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP3O75386 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP3O75386 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP3O75386 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP3O75386 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP3O75386 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP3O75386 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP3O75386 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP3O75386 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP3O75386 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP3O75386 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP3O75386 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP3O75386 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP3O75386 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP3O75386 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP3O75386 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP3O75386 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP3O75386 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP3O75386 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP3O75386 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP3O75386 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP3O75386 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP3O75386 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP3O75386 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP3O75386 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP3O75386 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP3O75386 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP3O75386 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP3O75386 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms