Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPIPB7O75200 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB7O75200 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPIPB7O75200 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPIPB7O75200 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB7O75200 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB7O75200 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB7O75200 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB7O75200 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB7O75200 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB7O75200 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB7O75200 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB7O75200 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB7O75200 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB7O75200 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB7O75200 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB7O75200 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms