Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA3O75145 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA3O75145 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 741.9 ms