Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stra6O70491 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stra6O70491 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stra6O70491 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stra6O70491 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stra6O70491 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra6O70491 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra6O70491 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra6O70491 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stra6O70491 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stra6O70491 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stra6O70491 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stra6O70491 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stra6O70491 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stra6O70491 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stra6O70491 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stra6O70491 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stra6O70491 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Stra6O70491 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stra6O70491 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stra6O70491 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stra6O70491 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stra6O70491 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms