Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSCO60682 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSCO60682 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSCO60682 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSCO60682 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSCO60682 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSCO60682 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSCO60682 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSCO60682 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSCO60682 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MSCO60682 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSCO60682 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSCO60682 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSCO60682 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSCO60682 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSCO60682 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSCO60682 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSCO60682 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSCO60682 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MSCO60682 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MSCO60682 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSCO60682 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSCO60682 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSCO60682 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSCO60682 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSCO60682 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSCO60682 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MSCO60682 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSCO60682 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSCO60682 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSCO60682 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MSCO60682 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MSCO60682 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MSCO60682 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MSCO60682 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MSCO60682 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSCO60682 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MSCO60682 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSCO60682 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MSCO60682 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MSCO60682 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSCO60682 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSCO60682 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSCO60682 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSCO60682 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSCO60682 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSCO60682 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSCO60682 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSCO60682 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSCO60682 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MSCO60682 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSCO60682 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSCO60682 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSCO60682 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSCO60682 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSCO60682 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSCO60682 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSCO60682 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSCO60682 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSCO60682 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSCO60682 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSCO60682 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSCO60682 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSCO60682 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSCO60682 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSCO60682 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSCO60682 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSCO60682 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSCO60682 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSCO60682 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSCO60682 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSCO60682 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSCO60682 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MSCO60682 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MSCO60682 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MSCO60682 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MSCO60682 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MSCO60682 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MSCO60682 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSCO60682 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSCO60682 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSCO60682 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSCO60682 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSCO60682 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSCO60682 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSCO60682 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSCO60682 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSCO60682 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSCO60682 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSCO60682 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MSCO60682 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSCO60682 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSCO60682 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSCO60682 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MSCO60682 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSCO60682 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MSCO60682 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MSCO60682 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSCO60682 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSCO60682 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms