Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCA5O60264 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCA5O60264 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCA5O60264 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms