Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cer1O55233 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cer1O55233 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cer1O55233 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cer1O55233 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cer1O55233 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cer1O55233 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cer1O55233 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cer1O55233 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cer1O55233 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cer1O55233 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cer1O55233 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cer1O55233 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cer1O55233 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cer1O55233 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cer1O55233 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cer1O55233 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms