Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITM2AO43736 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITM2AO43736 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITM2AO43736 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms