Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASA4O43374 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASA4O43374 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASA4O43374 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASA4O43374 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASA4O43374 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASA4O43374 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASA4O43374 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASA4O43374 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASA4O43374 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASA4O43374 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASA4O43374 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASA4O43374 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASA4O43374 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASA4O43374 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASA4O43374 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASA4O43374 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASA4O43374 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASA4O43374 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASA4O43374 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASA4O43374 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASA4O43374 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASA4O43374 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASA4O43374 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASA4O43374 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASA4O43374 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASA4O43374 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RASA4O43374 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASA4O43374 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASA4O43374 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASA4O43374 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASA4O43374 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASA4O43374 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASA4O43374 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASA4O43374 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASA4O43374 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASA4O43374 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASA4O43374 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASA4O43374 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASA4O43374 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RASA4O43374 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASA4O43374 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASA4O43374 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASA4O43374 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASA4O43374 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASA4O43374 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASA4O43374 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASA4O43374 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASA4O43374 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASA4O43374 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASA4O43374 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASA4O43374 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RASA4O43374 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RASA4O43374 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RASA4O43374 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASA4O43374 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASA4O43374 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASA4O43374 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASA4O43374 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASA4O43374 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASA4O43374 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASA4O43374 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASA4O43374 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASA4O43374 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASA4O43374 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RASA4O43374 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASA4O43374 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASA4O43374 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASA4O43374 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASA4O43374 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASA4O43374 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASA4O43374 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASA4O43374 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASA4O43374 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASA4O43374 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASA4O43374 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASA4O43374 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASA4O43374 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASA4O43374 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASA4O43374 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASA4O43374 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASA4O43374 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASA4O43374 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASA4O43374 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RASA4O43374 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASA4O43374 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RASA4O43374 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASA4O43374 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASA4O43374 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASA4O43374 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASA4O43374 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASA4O43374 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASA4O43374 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASA4O43374 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASA4O43374 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASA4O43374 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASA4O43374 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASA4O43374 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASA4O43374 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASA4O43374 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms