Protein–RNA interactions for Protein: O43318

MAP3K7, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K7O43318 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K7O43318 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K7O43318 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K7O43318 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms