Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCP110O43303 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCP110O43303 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCP110O43303 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCP110O43303 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCP110O43303 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCP110O43303 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCP110O43303 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCP110O43303 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCP110O43303 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCP110O43303 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCP110O43303 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCP110O43303 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCP110O43303 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCP110O43303 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCP110O43303 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCP110O43303 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCP110O43303 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCP110O43303 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCP110O43303 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCP110O43303 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCP110O43303 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCP110O43303 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCP110O43303 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCP110O43303 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCP110O43303 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCP110O43303 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCP110O43303 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCP110O43303 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCP110O43303 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCP110O43303 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCP110O43303 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCP110O43303 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCP110O43303 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCP110O43303 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCP110O43303 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCP110O43303 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCP110O43303 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCP110O43303 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCP110O43303 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCP110O43303 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCP110O43303 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCP110O43303 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCP110O43303 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCP110O43303 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCP110O43303 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCP110O43303 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCP110O43303 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCP110O43303 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCP110O43303 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCP110O43303 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCP110O43303 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCP110O43303 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCP110O43303 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCP110O43303 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCP110O43303 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCP110O43303 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCP110O43303 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCP110O43303 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCP110O43303 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCP110O43303 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCP110O43303 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCP110O43303 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCP110O43303 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCP110O43303 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCP110O43303 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCP110O43303 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCP110O43303 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCP110O43303 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCP110O43303 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCP110O43303 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCP110O43303 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCP110O43303 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCP110O43303 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCP110O43303 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCP110O43303 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCP110O43303 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCP110O43303 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCP110O43303 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCP110O43303 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCP110O43303 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCP110O43303 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCP110O43303 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCP110O43303 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCP110O43303 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCP110O43303 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCP110O43303 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCP110O43303 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCP110O43303 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCP110O43303 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCP110O43303 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCP110O43303 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCP110O43303 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCP110O43303 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCP110O43303 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCP110O43303 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCP110O43303 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCP110O43303 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCP110O43303 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCP110O43303 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms