Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC3O15379 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC3O15379 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC3O15379 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms